几个月后人员数量大幅度增加，就必须有个系统的规划了。
科研部飞石的总面积四十余万平方米，呈椭圆形。
现在主要利用的地区是北侧，分别是西北角占地五万平米的生活社区，最北边不是很规则的带状工厂区，以及位于中线以北的三栋科研楼，最东边氢氧储气站各一。中线以南只有距离储气站约两百米，新建的地面基站、天文台，和科研楼相比，两个都是小建筑，加中间的休息区一起面积还不如一栋科研楼。
经过谨慎的讨论，沈文剑出门，让外公黄大发去请几个土系反虚期的大佬来，帮忙把建筑移动一下。
因为科研部的建筑都有极高的水平要求，特别是三号楼，所以只能一号楼占了南边，基站和天文台搬到三号楼东边，重新调平。
趁此机会，把原本在社区外的食堂也丢到西边的南区，南区一起被划入生活社区，加上北区的总面积约九万平米。
在一号楼原址，新建了科研部后勤中心楼。
后勤中心楼包含了全新的地下仓库结构，有钢结构厚板与相应的禁法阵法，还有铅板的防辐『射』专用仓库，一楼常规仓库、后勤行政区。
搬到南边的一号楼旁边也新建了一栋工程院大楼，一、二楼全墙面可动，方便拆装机床等工程院常用设备。
另外，新建几栋员工楼也是必不可少的。
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