哈布斯堡王室家族成员流行与他们亲属结婚的传统，以此保持家族血统纯正。但此举却对他们的后代产生可怕的结果，这些遗传疾病在最后一位直系继承人卡洛斯二世身上的表现最明显。
卡洛斯二世绰号"中魔者"(西班牙语:El Hechizado)，因为当时的人们认为，卡洛斯二世的身体和心理疾病是巫术诅咒造成的结果。直到四岁后，卡洛斯二世才会讲话;直到8岁后，他才会走路;他的个子很矮，身体也相当纤瘦而且孱弱;他对周围的一切事物几乎都不感兴趣;他30岁的时候，看起来却老态龙钟，腿、脚、腹部以及脸上都浮肿;在他去世前的几年，他几乎不能自己站立，还遭受着幻觉和痉挛的折磨。
科学家们的研究显示，由于遗传祖先紊乱基因，卡洛斯二世至少遭受两种遗传疾病的困扰。一种是造成荷尔蒙失衡的垂体激素不足，影响了他的生长发育;第二种是肾疾。 此外，卡洛斯二世还患有家族成员特有的"哈布斯堡唇(下颌前突畸形)"畸形，他的舌头很大，以至于他说话困难，经常流口水。他的头也太大，肠道位置颠倒，身体经常抽搐等。
尽管卡洛斯二世身体畸形，并有严重的健康问题，但他依然结过两次婚，希望继续维持哈布斯堡王朝的统治。但是直到他39岁去世，也没有留下任何继承人，哈布斯堡王朝在西班牙的直系从此灭亡。
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