技能三忠贞：徐祖辉在认主之后，全属性提升5点，徐祖辉在被明主重用后，全属性额外提升5点。】
徐辉祖原名徐允恭，他是明初开国元勋、中山王徐达的长子，身高八尺五寸，英俊潇洒，颇有才气。
徐达数次外出镇守北平，留徐辉祖宿卫御家，家众肃然，于是明太祖心中非常器重他。
洪武十七年（1384年），徐辉祖以勋卫署左军都督府事，每月获赐禄米二十石。
洪武十八年（1385年），徐达自北平还，背疽复发，明太祖命徐辉祖奉手诏在中途迎接，不久徐达去世。
洪武二十一年（1388年）十月二十六日，徐辉祖袭封父亲的爵位魏国公，赐诰“扬中山王之烈，而勉公忠以立志，礼以守身，恪尽继承之道”。
不久，避皇太孙朱允炆名讳，改名徐辉祖。
洪武二十二年（1389年）三月，颍国公傅友德等回师，分驻湖广、四川诸卫所，以“休息士卒”、“控制蛮夷”。
徐辉祖亦受命驻守常德府，四月，徐辉祖奉命于湖广各卫所考察军士，练兵备边。
十二月，被召回南京应天府（今江苏南京），后又让他回到凤阳的御赐宅第，“以岁时入觐”，不久赐兵一百二十人作为护卫。
洪武二十四年（1391年）三月，徐辉祖前往陕西练兵防边。
洪武二十六年（1393年）二月，据称燕王府的北元降将阿鲁帖木儿、乃儿不花别有所图。
三月，徐辉祖受太祖之命，与燕王朱棣将阿鲁帖木儿等抓捕，押送南京 ，回朝之后，掌管中军都督府事务。
洪武二十七年（1394年）三月，徐辉祖与安陆侯吴杰前往浙江训练沿海军士，以防备海上倭寇入侵，九月，徐辉祖受命节制陕西都指挥使司将士，以待次年春季征讨西番。
洪武二十八年（1395年）十一月，徐辉祖前往凤阳府训练军马。
洪武二十九年（1396年）四月，徐辉祖与礼部、翰林院官员共同前往国子监，考核国子师生。
徐辉祖常常陪侍于皇太孙左右，因此得以学习经书大义，又随书法名家詹希元练习书法，擅长写大字。
洪武三十一年（1398年）闰五月，太祖驾崩，皇太孙即位，即建文帝。
建文帝对徐辉祖特加信任，于同年八月加拜他为太子太傅。
建文元年（1399年）正月，建文帝下诏修《太祖高皇帝实录》，命徐辉祖为监修。
四月，将逢太祖忌日，朱棣派三子朱高炽、朱高煦、朱高燧入京。
等三人到了南京，大臣齐泰请求建文帝把他们一并留下，黄子澄说：“不可以。怀疑他而作此准备，是有害的，不如把他们全部遣返。”
徐辉祖此时秘密奏报说：“我的三个外甥中，只有朱高煦勇猛剽悍而且无赖。他不但不忠于陛下，也会背叛他的父亲，他日一定会成为大患。”
建文帝询问徐辉祖的弟弟徐增寿和驸马王宁的意见，二人加以包庇，于是将三人遣返归国。
朱高煦偷了徐辉祖的马逃跑。徐辉祖派人去抓，没有追上，建文帝听说了，就把他当做亲信。
此后不久，朱棣发动靖难之役。在战役期间，朱高煦作为燕军主将出力甚多，建文帝说：“我后悔不用徐辉祖的建议！”
建文三年（1401年）四月，建文帝担心南军主帅李景隆轻敌，于是命徐辉祖率领三万京军驰援。
同月，南军在白沟河之战中惨败，损失十数万，李景隆等溃逃至德州，徐辉祖率军殿后，掩护李景隆等撤回，全师而还。
建文四年（1402年）正月，朝廷命徐辉祖带兵北上，四月，与燕军大战于宿州灵壁县西南三十里的齐眉山，南军获胜，斩杀燕军骁将、蔚州卫千户李斌等。南军再次获得胜利，再加上暑热，燕军陷入窘境。
这时，朝廷讹传燕军已兵败，京师不可无良将，遂召回徐辉祖，淮北的何福、平安等中央军因此势孤而大败。
等到燕军准备渡过长江时，徐辉祖仍率军在浦子口迎击，成功阻击燕军。
南军大将盛庸再战，遭遇大败，水师尽归于燕军，燕军于是得以渡江，攻克南京金川门，入主南京。
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