游戏进行到后期，也全员进化成究极体。
阿特拉独角仙兽（蓝）进化为小丑皇
小丑皇Piedmonピエモン
究极体
魔人型
病毒种
名字来源：法语【Pierrot】小丑、德语【Pied Piper of Hamelin】花衣魔笛手
技能：王牌飞剑
奇特的模样、神出鬼没，一切都被谜团包围的魔人型数码兽。魔人型数码兽谜点颇多，与恶魔系、不死系相比，完全是异次元的存在，真面目完全不清楚。到底是为什么出现的，存在目的也不清楚，现阶段还没有手段能够解开这些谜团。但是，其力量强大无比，如果遇到小丑兽就只能诅咒自己的命运。必杀技是心灵传输（Teleport）插在背后「魔术箱（Magic Box）」的四把剑，在下一瞬间穿刺敌人的无法逃脱的技能「王牌飞剑」。
敏捷型
蛇颈龙兽Plesiomonプレシオモン
究极体
长颈龙型
数据种
名字来源：希腊语【Plesiosaur】蛇颈龙
技能：悲伤蓝调
英国未确认生物研究所的计算机内被发现的虚构存在的数码兽。是一个已经在研究者之间成为传闻的数码兽。鲜有现身，被迷雾包围能见度很低的情况下似乎会出现。被洗练到闪耀着白色光辉，神秘的蛇颈龙兽的身姿给人留下深刻的印象。「悲伤蓝调」是发出尖锐、清脆的鸣叫，让听者沉浸在悲伤中而失去战斗意识。
辅助型
三角龙兽进化成狮鹫兽
狮鹫兽Griffomonグリフォモン
究极体
幻兽型
数据种
名字来源：英语【Griffonグリフォン】狮鹫
技能：超声波音频
拥有鸟型数码兽的头、翅膀和前足，躯体为兽型数码兽，尾巴长有像蛇一样东西的合体数码兽。可以用其翅膀在天空中翱翔，据说平时生活在沙漠地带和山岳地带的洞窟中。另外，狮鹫兽的攻击力非常高，以敏捷的动作玩弄敌人，因此想打败狮鹫兽是极其困难的。充分发挥自己的性能，充当防止互联网上非法入侵的看守者，以及作为机密情报的安全保障。必杀技是发出超高频的音波，破坏敌人数据结构的「超声波音频」。
攻击型
大锹形虫兽进化为匹诺曹兽
木偶兽Puppetmonピノッキモン
究极体
玩偶型
病毒种
名字来源：意大利语【Pinocchioピノッキオ】匹诺曹 、英语【Puppet】木偶；傀儡
技能：弹丸重锤
用被诅咒的树灵兽的身体制作出来的终极玩偶数码兽。一般认为恐怕是一个凶恶的黑客用树灵兽的数据造出了这个匹诺曹兽。木偶般的模样，但能以自己的意志行动。性格恶劣，是个谎话大王，计算机提示出错信息的时候，就是匹诺曹兽搞的鬼。必杀技是把火药塞进左轮型铁锤并敲击的最强技能「弹丸重锤」。受到这个技能攻击的话，不仅有锤子的打击还会因为火药的爆炸而消失得无影无踪吧。
平衡型
老爷怪蛙兽进化成战斗暴龙兽。
战斗暴龙兽WarGreymonウォーグレイモン
究极体
龙人型
疫苗种
名字来源：英语【Warrior】战士、勇士、英语【Great】巨大的
技能：盖亚之力、勇气龙卷风
身着超金属「时之数码合金」之铠的最强龙战士，暴龙兽系数码兽的终极形态。与暴龙兽系数码兽中看到的巨大形态不同，他拥有人型的形态，不过速度、力量却有着飞跃性的提高，完全体数码兽的攻击程度是不可能打败他的。双臂装备的「龙兽克星（Dramon Killer）」对龙兽系数码兽能发挥巨大威力，但同时也会让自身陷入危险，因此是把双刃剑。另外，把背部装备的外壳合而为一体的话，就会形成最强硬度的盾「勇气之盾（Brave Shield）」。据说在历战的强者之中，当真正的勇者觉悟到了自己的使命，才会进化为战斗暴龙兽。必杀技是让大气中存在的全部能量集中于一点，放出超高密度的高热能量弹「盖亚之力」。以及双臂的「龙兽克星」在头上合十，高速旋转着突击将敌人贯穿的「勇气龙卷风」。
平衡型
神圣天使兽进化为金属加鲁鲁兽。
钢铁加鲁鲁兽MetalGarurumonメタルガルルモン
究极体
改造型
数据种
名字来源：英语【Metal】金属、日语【がるる】吼叫的拟声词
技能：冰狱冷冻气、加鲁鲁战斧、慈悲交错冷库
加鲁鲁兽的最终形态，通过几乎全身金属化而提升力量。即使金属化也没有失去天生的敏捷，使用全身隐藏的无数武器粉碎敌人。位于鼻尖的四个激光照准器照射出不可见的激光，可以使用红外线、X射线等所有传感器（Sensor）分析前方的目标物，因此就算在视野不能达到的黑暗中，想从金属加鲁鲁兽眼皮底下逃掉也是不可能的。此外，从背部延伸的机臂放出光束状的翼，可以在网络空间以超高速自由飞翔。必杀技是吐出让所有东西都冻结的绝对零度冷气「冰狱冷冻气」。受到该技能攻击的敌人会瞬间停止生命活动。以及从胸部发射名为冰冻炸弹（Freeze Bomber）的巨大导弹的「加鲁鲁战斧」，还有同时发射金属加鲁鲁兽所持武器的「慈悲交错冷库」肃清全部敌人。
攻击型
祖顿兽进化为怨毒吸血魔兽。
怨毒吸血魔兽VenomMyotismonヴェノムヴァンデモン
究极体
魔兽型
病毒种
名字来源：英语【Venom】毒液，怨恨、英语【Vampire】吸血鬼 、英语【Demon】邪灵 、拉丁语【Myotis】鼠耳蝠属，蝙蝠科中的一个属
技能：剧毒流注
拥有野兽的下半身和甲虫般外壳的上半身的魔兽，黑暗之王吸血魔兽进化后的真面目。释放了隐藏力量的怨毒吸血魔兽有的只是破坏与杀戮的冲动，原本绅士的举止、保持理性与知性的吸血魔兽，非常讨厌暴露这个丑陋的真面目。必杀技是将破坏型计算机病毒注入到敌方数码兽体内，将其构成数据全部破坏并导致机能停止的「剧毒流注」。
攻击型
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