米花町2丁目，阿笠博士家那栋总是冒出奇怪声响和可疑气味的宅邸，悄然迎来了新的住客。
温暖的晨光透过窗户，洒在略显凌乱却充满生活气息的客厅里。阿笠博士看着餐桌旁坐着的两个“女孩”，胖脸上洋溢着慈祥又有些拘谨的笑容。
“灰原哀”安静地坐在椅子上，小口小口地喝着牛奶，身上穿着合身的童装，茶色的短发梳理得整整齐齐。那张精致却总带着一丝疏离感的小脸上，冰蓝色的眼眸低垂着，似乎在专注地看着杯中的倒影，又仿佛沉浸在无人知晓的思绪中。她身上那种超越年龄的冷静气质，让博士时常忘记她外表只是个一年级的小学生。
坐在她旁边的，则是她的“母亲”——“灰原爱”。这是一位看起来三十岁左右、气质温婉娴静的女性。她有着一头柔顺的深棕色短发，戴着无框眼镜，穿着素雅的针织衫和长裙，正细心地帮“女儿”把煎蛋切成小块。她的动作温柔而自然，眼神中充满了对“女儿”的关爱。然而，只有极少数人知道，这张平凡而温顺的脸庞下，隐藏着的是宫野明美坚韧的灵魂，以及经由悠真提供的、源自系统的顶级易容面具塑造出的全新面容。面具的材质和工艺远超时代，完美贴合，毫无破绽，甚至连细微的表情都能自然呈现，足以瞒过组织的眼线和面部识别系统。
“爱小姐，哀酱，早餐还合口味吗？”博士搓着手，有些紧张地问。照顾两个“孤儿寡母”，对他这个单身老宅男来说，是个不小的挑战。
“非常美味，博士，谢谢您。”“灰原爱”（明美）抬起头，露出一个温婉得体的笑容，声音经过刻意的调整，带着一丝关西口音的柔和，与原本的宫野明美截然不同，“以后就麻烦您多照顾了。”
“哪里哪里！有你们在，家里热闹多了！”博士乐呵呵地说，目光落在小哀身上，“哀酱今天感觉怎么样？要不要和柯南君一起去学校看看？帝丹小学的环境还是很不错的哦。”
灰原哀抬起眼皮，淡淡地扫了一眼旁边正努力消灭早餐、假装自己是普通小孩的柯南，嘴角几不可察地撇了一下，带着一丝不易察觉的嘲讽：“暂时不用。我需要适应一下……普通人的生活节奏。” 她的声音清冷，带着孩童的稚嫩音色，却毫无孩童的天真。
柯南回敬了她一个半月眼。这个变小了的科学家，毒舌和冷淡的程度简直比原来更甚。
早餐在一种微妙的平静中进行。明美（灰原爱）努力扮演着一位平凡、略带忧郁却坚强乐观的单亲母亲，细心照顾着“体弱多病、性格内向”的女儿。而灰原哀则完美地诠释了一个早慧、安静、对陌生环境略带警惕的小女孩。只有柯南和博士知道，这份平静之下，涌动着怎样的暗流。
与此同时，在城市另一端一间经过严格加密的废弃仓库内，气氛却截然不同。
空气冰冷，弥漫着灰尘和机油的味道。巨大的集装箱如同沉默的巨人，投下深邃的阴影。几盏强光灯将仓库中央一小片区域照得亮如白昼。
悠真依旧隐在入口处的阴影中，如同一尊没有生命的雕像。他的对面，站着几个身影。为首的男人身材高大，穿着黑色夹克，戴着针织帽，帽檐压得很低，遮住了大半张脸，只露出线条冷硬的下颌和一双锐利如鹰隼、仿佛能穿透人心的墨绿色眼眸。正是FBI的王牌搜查官——赤井秀一。他身后站着几位同样气息精悍、训练有素的探员，包括面容姣好却神情严肃的朱蒂·斯泰琳。
“东西带来了。”赤井秀一的声音低沉而富有磁性，带着一丝美式口音。他示意了一下，一名探员将一个密封的金属冷藏箱放在两人中间的地上。
悠真没有动，冰冷的声音通过变声器传出，在空旷的仓库内回荡：“确认目标信息：杯户町码头，明晚23：00，‘黑船’号货轮，第三号冷藏集装箱。目标人物：沼渊己一郎（状态：重伤昏迷，已无利用价值），以及……‘宫野志保’（状态：死亡）。”
“死亡？”朱蒂忍不住出声，语气带着质疑，“我们收到的情报显示她只是失踪！而且……”
“情报更新。”悠真打断她，语气不容置疑，“组织叛逃科学家宫野志保，于逃脱过程中遭遇我方拦截，激烈反抗后被击毙。尸体因特殊原因（APTX4869残留效应）呈现幼化状态，但已无生命体征。DNA样本在箱内。” 他指了指地上的冷藏箱。
赤井秀一墨绿色的眼眸锐利地盯着阴影中的悠真，仿佛要穿透那层黑暗，看清对方的真容和意图。他能感觉到，眼前这个神秘人实力深不可测，并且掌握着远超FBI想象的核心情报，包括组织最机密的药物项目！对方主动联系FBI，抛出“雪莉已死”和沼渊这个弃卒作为诱饵，显然有着更深层的目的。
“你想借FBI的手，演一场戏给组织看？”赤井秀一直接点破，“用沼渊和‘雪莉’的尸体，打消组织对APTX4869能让人变小的疑虑？让他们相信工藤新一确实死了，宫野志保也死了，一切只是药物残留导致的尸体异常？”
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