汉元帝让京房举荐他的弟子中通晓考功课吏事的人，打算试用。京房举荐了“中郎任良、姚平，希望能让他们担任刺史，试行考功课吏法；我能够在殿中记名，负责奏事，以防止下情被阻塞。”石显、五鹿充宗都忌恨京房，想把他支开，就建议说，应该让京房去担任郡守试试。于是汉元帝任命京房为魏郡太守，允许他用考功课吏法治郡。
京房自己请求说：“到了年底，我希望能乘坐驿站的传车回朝奏事。”汉元帝答应了他。京房自己知道因为多次发表议论被大臣们反对，又与石显等人有矛盾，不想远离皇帝身边，于是呈递密封的奏章说：“我出京之后，恐怕会被掌权者蒙蔽，身死而功业无成，所以希望年底能乘传车回朝奏事，承蒙陛下哀怜答应了我。在辛巳日，蒙气又遮蔽了太阳，太阳的颜色被侵，这表明上大夫遮蔽君主而陛下心里也有疑虑。在己卯日到庚辰日之间，必定有人想要隔绝我，使我不能乘传车回朝奏事。”
京房还没出发，汉元帝就让阳平侯王凤奉诏命告诉京房，不要乘传车回朝奏事。京房心里越发恐惧。
秋天，京房离开京城到了新丰，通过邮差呈递密封奏章说：“我之前在六月中说《遁卦》的预兆没有应验，占法说：‘有道之人刚离开，就会有洪水涌出造成灾害。’到了七月，洪水果然涌出。我的弟子姚平对我说：‘京房可以说是懂得道术，但不能说是相信道术。京房说的灾异，没有不应验的。洪水已经涌出，有道之人就该因预言而死，还有什么可说的呢！’我说：‘陛下极其仁爱，对我尤其宽厚，即便说了会死，我还是要说。’姚平又说：‘京房可以说是小忠，不能说是大忠。从前秦朝赵高掌权，有个叫正先的人，因指责赵高而死，赵高的威势从此形成，所以秦朝的混乱，正先是促使其发生的人。’如今我得以出任郡守，自己承诺要做出功效，恐怕还没做出功效就死了，希望陛下不要让我因为阻塞洪水这类灾异预言，而像正先那样死去，被姚平嘲笑。”京房到了陕县，又呈递密封奏章说：“我之前建议让任良试行考功课吏法，我留在朝中。议论的人知道这样对他们不利，我又无法被蒙蔽，所以说‘与其让弟子试行，不如让老师试行。’我要担任刺史，又要奏事，所以他们又说‘担任刺史，恐怕太守不会同心，不如让他担任太守。’这就是他们隔绝我的手段。陛下没有违背他们的话，就听从了他们，这就是蒙气无法消散、太阳没有光彩的原因。我离开朝廷越来越远，太阳被侵的颜色就越厉害，希望陛下不要觉得召回我有困难，而轻易违背天意。邪说虽然能让人暂时心安，但天气一定会变化，所以人可以被欺骗，天却不可被欺骗，希望陛下明察。”
京房离开京城一个多月后，最终被征召下狱。当初，淮阳宪王的舅舅张博，为人狡诈品行不端，经常向淮阳王索要金钱，想为淮阳王谋求入朝的机会。张博跟随京房学习，还把女儿嫁给了京房。京房每次朝见皇帝回来，就把和皇帝说的话告诉张博。张博就记录下京房说的机密话语，让京房为淮阳王撰写请求入朝的奏章草稿，都拿着去给淮阳王看，作为凭证。石显得知此事，告发京房与张博合谋，诽谤政治，把过错归到皇帝身上，误导诸侯王。京房和张博都被下狱，判处死刑，他们的妻子儿女被流放到边疆。郑弘因为与京房关系好，被免官成为平民。
御史中丞陈咸多次诋毁石显，过了很久，因为和槐里令朱云关系好，泄露了宫中的话，被石显暗中探知，陈咸与朱云都被下狱，被剃去头发罚做城旦。
石显的权势日益盛大，公卿以下的官员都畏惧石显，走路都不敢出声，小心翼翼。石显与中书仆射牢梁、少府五鹿充宗结成党羽，那些依附他们的人都得到了宠信的官位，百姓编歌唱道：“牢梁啊！石显啊！五鹿充宗啊！他们的官印多么累累，绶带多么飘飘啊！”
石显心里明白自己独揽大权，生怕皇帝一旦听信身边人的话来怀疑自己，于是时常向皇帝表示忠诚，拿一件事来获取皇帝的信任作为验证。石显曾经奉命到各官府办事，需要征调物资，他事先向皇帝禀告：“恐怕回来晚了宫门关闭，请陛下允许我拿着诏令让官吏开门。”皇帝答应了他。石显故意在夜里回来，声称有诏令让开门进入。后来果然有人上书告发“石显专擅命令，假传诏令打开宫门”，皇帝听说后，笑着把奏章拿给石显看。石显趁机哭泣着说：“陛下过分偏爱我，把事务交给我处理，下面的人没有不嫉妒的，都想陷害我，像这样的事情不止一件，只有圣明的君主了解我。我身份低微，实在不能以一人之身让众人满意，承受天下人的怨恨。我希望归还掌管中枢机要的职位，去后宫做打扫的差役，这样死了也没有遗憾。希望陛下怜悯我，恩赐我，以此保全我的性命。”皇帝认为他说得对，很怜悯他，多次慰劳勉励石显，给他丰厚的赏赐，赏赐加上别人贿赂他的财物，价值一万万。当初，石显听说众人纷纷传言是他害死了前将军萧望之，担心天下的学士诋毁自己，因为谏大夫贡禹精通经学且有高洁的气节，于是派人向贡禹表达心意，与他深深结交，趁机向皇帝举荐贡禹，贡禹历任九卿之职，石显对他礼节周到。于是有人称赞石显，认为他没有嫉妒诬陷萧望之。石显施展权术欺诈来为自己解脱、取得皇帝信任，都是这类手段。
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